Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms