Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms