Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Asb4-202ENSMUST00000183358 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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