Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atf6bO35451 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atf6bO35451 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atf6bO35451 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atf6bO35451 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Atf6bO35451 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atf6bO35451 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atf6bO35451 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atf6bO35451 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atf6bO35451 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atf6bO35451 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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