Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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