Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KeraO35367 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KeraO35367 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KeraO35367 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KeraO35367 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KeraO35367 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KeraO35367 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KeraO35367 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KeraO35367 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KeraO35367 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KeraO35367 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
KeraO35367 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KeraO35367 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KeraO35367 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KeraO35367 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KeraO35367 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KeraO35367 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
KeraO35367 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KeraO35367 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms