Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms