Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Kcns1O35173 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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