Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms