Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms