Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20878L7N244 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20878L7N244 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20878L7N244 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20878L7N244 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20878L7N244 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20878L7N244 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20878L7N244 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20878L7N244 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms