Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm8888J3QPX5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm8888J3QPX5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8888J3QPX5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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