Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms