Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms