Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms