Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3tc1G3X9F6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3tc1G3X9F6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms