Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms