Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp32F8VPZ3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms