Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-M1F7CXU4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms