Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm8247F6VRJ8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms