Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp988F6VKC7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms