Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmod3E9QA62 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms