Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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