Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BC005561E9Q5E2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms