Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms