Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms