Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gimd1E9PW74 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms