Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3002E9PW72 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms