Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms