Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms