Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms