Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmf1B9EKI3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms