Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms