Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms