Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt4B2RU40 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms