Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrn3B2RS91 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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