Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms