Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms