Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms