Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl41A2AUC9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms