Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms