Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34dA2AGU5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34dA2AGU5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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