Protein–RNA interactions for Protein: A2A8C4

Gm13040, Predicted gene 13040, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13040A2A8C4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm13040A2A8C4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms