Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbf1A2A870 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms