Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trav12-2A0N8N6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trav12-2A0N8N6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trav12-2A0N8N6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trav12-2A0N8N6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trav12-2A0N8N6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trav12-2A0N8N6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trav12-2A0N8N6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trav12-2A0N8N6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trav12-2A0N8N6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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