Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3238W4VSP7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3238W4VSP7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms