Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms