Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gria4Q9Z2W8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms