Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc23a1Q9Z2J0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms