Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms